ФОРМИРОВАНИЕ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ РЕБЕНКА И ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА ЭТОТ ПРОЦЕСС
- В настоящее время доказано, что нарушение состава кишечной микробиоты повышает риск или является непосредственной причиной развития инфекционных и неинфекционных заболеваний. Показано, что при избыточном бактериальном росте, повышении проницаемости слизистой кишечника, снижении иммунного статуса макроорганизма развиваются условия для бактериальной транслокации, бактериемии и сепсиса [7]. С угнетением индигенной анаэробной флоры антибиотиками и активизацией условно-патогенных микробов (C. difficile, S. aureus, Candida albicans, Klebsiella oxytoca) связано развитие инфекционной антибиотикоассоциированной диареи [8]. Кишечный микробиоценоз является основным источником уропатогенной флоры (E. coli, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae) [9]. Имеются доказательства роли дисбиозной кишечной микрофлоры в формировании ожирения и сахарного диабета 2-го типа, а также атеросклероза и артериальной гипертензии [10–12]. Нарушение состава и функции кишечной микробиоты ассоциируется с развитием воспалительных заболеваниий кишечника и рака толстой кишки [13, 14]. Доказано, что нарушение состава кишечной микрофлоры может быть причиной атопических заболеваний (бронхиальная астма, атопический дерматит, аллергический ринит) [15, 16]. Имеются доказательства связи дисбиоза кишечной микрофлоры с развитием нейродегенеративных заболеваниий головного мозга [17].
Наиболее чувствительна к воздействию неблагоприятных факторов неонатальная микробиота. Данные литературы свидетельствуют о том, что воздействие антибиотиков на «незрелую» микробиоту новорожденного ребенка приводит к снижению разнообразия состава кишечной микрофлоры, что делает ребенка более подверженным инфекционным и неинфекционным заболеваниям [18, 19]. Дети, получавшие антибиотики в раннем неонатальном периоде, имеют более высокий риск развития атопических заболеваний в течение первого года жизни, а также бронхиальной астмы, воспалительных заболеваний кишечника, ожирения в более позднем возрасте [20, 21]. Метаболиты кишечных микробов играют важнейшую роль в формировании и деятельности головного мозга и, таким образом, могут влиять на формирование когнитивных функций и поведение ребенка [22, 23]. При исследовании фекалий детей, страдающих аутизмом, выявлено снижение содержания микроорганизмов трех бактериальных родов: Prevotella, Coprococcus и Veillonellaceae [24]. По данным А. Ekiel и соавт. (2010), у детей с аутизмом чаще выделяются клостридии и энтерококки и реже – лактобациллы [25]. Получены обнадеживающие (в плане улучшения социального поведения) результаты фекальной трансплантации от здоровых доноров детям, страдающим аутизмом [26].
По мнению многих ученых, внутриутробный и неонатальный периоды – критические этапы формирования микробиома ребенка, от которых во многом зависит состояние его здоровья в течение всей жизни [27, 28]. - Рамосум имеет неизвестные не изученные генотоксины.
- 1.Низкомолекулярные метаболиты грамположительных бактерий (включая штаммы Clostridium perfringens и Clostridium ramosum ) и грамотрицательных бактерий (включая несколько штаммов Morganella morganii ) непосредственно повреждали ДНК в бесклеточных анализах и индуцировали экспрессию маркера DSB γ. -H2AX и остановка клеточного цикла в эпителиальных клетках.
2.В то время как как малые, так и крупные молекулы B. Teenagenis и C. perfringens индуцировали повышение γ-H2AX, только низкомолекулярные метаболиты C. ramosum и M. morganii проявляли генотоксичность
3.На основании этих результатов мы выбрали C. perfringens , C. ramosum и M. morganii для дальнейшего изучения и подтвердили, что низкомолекулярные метаболиты этих штаммов индуцируют γ-H2AX в клетках HeLa, хотя и на пониженном уровне по сравнению с хорошо известный химический препарат цисплатин, сшивающий ДНК
4.Низкомолекулярные метаболиты C. perfringens , C. ramosum и M. morganii также вызывают остановку клеточного цикла в клетках HeLa ( рис. 2B ), что еще больше указывает на то, что эти таксоны являются потенциальными продуцентами генотоксина.
5.Чтобы обогатить генотоксичные малые молекулы, мы провели экстракцию этилацетатом с использованием супернатантов и обнаружили, что экстракты из культур C. perfringens (NWP4), C. ramosum (NWP50), M. morganii (NWP135) и clb+ E. coli разрывают кольцевую плазмидную ДНК pUC19. , тогда как экстракты из clb-E. coli или среды сами по себе оказывали незначительное влияние на целостность ДНК
6.Действительно, генотоксичные штаммы C. perfringens и C. ramosum также способствовали развитию колоректальных опухолей у гнотобиотических мышей по сравнению с негенотоксичным имитационным сообществом
7.Примечательно, что соматические мутации могут быть обнаружены в эпителиальных клетках толстой кишки человека даже в раннем возрасте, что предполагает постоянный мутагенез на протяжении всей жизни человека ( 46 , 47 ), а распространение мутированных клонов, связанное с колитом, может влиять как на патогенез ВЗК, так и на восприимчивость к КРР (46, 47). 48 ). Более того, хотя у пациентов с КРР наблюдается повышенное носительство clb+ E. coli , таксоны clb+ (включая родственников E. coli , такие как виды Klebsiella ) также обнаруживаются у здоровых людей ( 49 ). Недавние исследования также показали, что повышенная оксигенация эпителия во время колита может стимулировать экспансию clb+ E. coli посредством аэробного дыхания, увеличивая опосредованную колибактином активность CRC ( 50 ). Эти наблюдения подтверждают модель, согласно которой генотоксичные кишечные микробы способствуют развитию КРР, постоянно вызывая повреждение ДНК в эпителиальных клетках хозяина, что синергизирует с хроническим воспалением в микроокружении кишечника, а также с дополнительными факторами окружающей среды и в конечном итоге способствует инициированию и прогрессированию КРР.
8.Генотоксины, полученные из микробиоты, также могут влиять на различные аспекты биологии хозяина, помимо инициации опухоли. Недавние исследования показали, что колибактин также влияет на состав микробиома кишечника ( 51 ), усугубляет лимфопению и септицемию ( 52 ), запускает индукцию профагов посредством бактериального SOS-ответа ( 53 ) и ограничивает колонизацию Vibrio cholerae ( 54 ). Таким образом, генотоксины комменсального происхождения, включая индолимины, также могут опосредовать разнообразные биологические функции. - 1.Периферический серотонин (5-гидрокситриптамин: 5-НТ), синтезируемый в кишечнике энтерохромаффинными клетками (ЭК), играет важную роль в регуляции перистальтики кишечника, эпителиальной секреции и способствует развитию и поддержанию кишечных нейронов. Недавние исследования показали, что местная микробиота кишечника модулирует передачу сигналов 5-HT и что ЭК используют сенсорные рецепторы для обнаружения сигналов, полученных из пищи и микробиоты из просвета кишечника, для последующей передачи информации в нервную систему.
2.Использование стерильных мышей и мышей, моноассоциированных с C. ramosum , линии кишечных клеток и органоиды мыши, мы продемонстрировали, что компоненты бактериальных клеток стимулируют секрецию 5-НТ хозяина и программируют дифференцировку предшественников ствола толстого кишечника в сторону секреторной линии, продуцирующей 5-НТ.
3.В свете этих недавних результатов мы предположили, что C. ramosum способствует ожирению, модулируя доступность 5-HT в эпителии кишечника. В этом исследовании мы использовали мышей, лишенных микробов или моноассоциированных с C. ramosum , линии клеток кишечника и поджелудочной железы, а также органоиды тонкой и толстой кишки мыши, чтобы продемонстрировать, что клеточные компоненты C. ramosum стимулируют секрецию 5-HT из энтерохромаффинных клеток, способствуя дифференцировке предшественников кишечного ствола в сторону секреторной линии, продуцирующей 5-HT
4.Мы предположили , что присутствие C. ramosum увеличивает выработку 5-НТ в кишечнике и тем самым может способствовать абсорбции жирных кислот и развитию ожирения.
5.Уровни мРНК нескольких генов, участвующих в транспорте и хранении липидов, были повышены в подвздошной и толстой кишке мышей Cra, получавших HFD, по сравнению с мышами GF, получавшими ту же диету: кластер дифференциации 36 ( Cd36 ), белок-транспортер жирных кислот 4 ( Fatp4 ), кишечный белок, связывающий жирные кислоты ( Ifabp ) и перилипин 2 ( Plin2 ) (рис. 5Аи S4A ), что позволяет предположить повышенное всасывание свободных жирных кислот в подвздошной и толстой кишке. Анализы экспрессии генов подтвердили уровень белка CD36 и FATP4 в ткани толстой кишки (рис. 5Б, S4H и S5A ). Более того, экспрессия Ppar-α была увеличена в толстой и подвздошной кишке мышей Cra, получавших HFD, по сравнению с мышами GF, получавших HFD, тогда как экспрессия Ppar-α была снижена (рис. 5Би S4B ). Интересно, что экспрессия генов Ppar-α в подвздошной и толстой кишке , а также Cd36 , Fatp4 и Ifabp в подвздошной кишке была выше у мышей Cra, чем у мышей GF, даже при кормлении LFD, что позволяет предположить, что C. ramosum в определенной степени влияет на всасывание липидов в кишечнике независимо от диеты
6.Большая часть 5-НТ в организме синтезируется в кишечнике, особенно в толстом кишечнике, где плотность клеток микробиоты самая высокая. Несколько исследований недавно выявили роль кишечных бактерий в регуляции доступности 5-НТ 24 , 25 , 35 , 36 . Наша нынешняя работа предлагает механистическую связь, которая помогает понять, как кишечная бактерия C. ramosum может способствовать ожирению и идентифицирует 5-НТ хозяина как ключевую сигнальную молекулу. Здесь мы демонстрируем, что C. ramosum способен контролировать уровни 5-HT в плазме, кишечнике и eWAT преимущественно путем стимуляции секреции 5-HT, что, в свою очередь, способствует развитию ЭК, продуцирующих 5-HT, в кишечнике и приводит к дальнейшему повышению уровня 5-HT.
7.Высвобождение 5-HT должно строго контролироваться, поскольку длительное хранение может способствовать диарее, вызванной холерным токсином, и поражению сердца 5 , 37 , 38 . Мы наблюдали увеличение деградации 5-HT и снижение его дальнейшего поглощения тканями кишечника у мышей Cra по сравнению с мышами GF, что было установлено по уровням экспрессии генов Maoa и Sert . Чтобы подтвердить эти результаты , мы стимулировали хромаффинные клетки, а также SI и органоиды толстой кишки C. лизаты клеток ramosum или бактериальные супернатанты. В то время как С. лизаты клеток ramosum приводили к повышенному высвобождению 5-НТ, бактериальные супернатанты имели лишь умеренный эффект.
8.Наши данные согласуются с недавним отчетом, показывающим, что спорообразующие бактерии и некоторые из их метаболитов, особенно дезоксихолат, стимулируют высвобождение 5-HT из ECs 25 . Спорообразующие бактерии, использованные в этом эксперименте, в основном представляли собой виды Clostridium , которые превращают холат во вторичный дезоксихолат желчных кислот 39 , 40 . Однако в предыдущих экспериментах на мышах-гнотобиотиках мы не обнаружили повышенных концентраций дезоксихолата у мышей, несущих C. ramosum в содержимом просвета тонкой, слепой или толстой кишки (данные не показаны). В отличие от наблюдений, сделанных в этом исследовании 25, мы обнаружили, что растворимые факторы, полученные из микробиоты, менее эффективны в индукции секреции 5-НТ, чем компоненты бактериальных клеток. Для идентификации этих компонентов потребуются дополнительные эксперименты, выходящие за рамки настоящей статьи.
9.Периферический 5-HT влияет на моторику желудочно-кишечного тракта и секрецию пищеварительных ферментов, способствует заживлению ран8 , висцеральной гиперчувствительности9 , привлекает нейтрофилы к месту острого воспаления, стимулирует выработку провоспалительных цитокинов10 и ингибирует костеобразование11. Интересно, что 5-НТ оказывает влияние на ожирение.
10.Противоположные эффекты на мозг и периферические органы. 5-HT, вырабатываемый мозгом, рассматривается как мишень против ожирения, поскольку он обладает сильным аноректическим эффектом12–14, тогда как повышенные уровни периферического 5-HT связаны с увеличением веса и ожирением у мышей и крыс15–17. Несколько полногеномных исследований на людях связали серотонинергическую систему с ожирением14. Однонуклеотидные полиморфизмы в Tph1 и генах 5-НТ-рецепторов были значимо связаны с ожирением18–20. Более того, недавнее исследование на людях показало, что люди, страдающие ожирением, обладают повышенной способностью вырабатывать и высвобождать 5-НТ в тонком кишечнике21. Сообщалось, что, с одной стороны, диета, богатая жирами, увеличивает выработку 5-НТ у крыс, получавших западную диету, и у мышей, получавших HFD15,17, а с другой стороны, повышенные уровни 5-НТ в плазме также наблюдались во время голодания со значениями значительно выше, чем обычно наблюдается22,23. Накопленные данные указывают на то, что микробиота кишечника играет важную роль в контроле доступности 5-HT посредством воздействия короткоцепочечных жирных кислот24, вторичных желчных кислот и нескольких метаболитов, полученных из микробиоты25. Передавая сигнал энтерохромафну толстой кишки, эти молекулы, вероятно, способствуют биосинтезу 5-HT25. Поскольку ожирение связано с изменениями в составе кишечного микробного сообщества как у людей, так и у мышей26–28, микробиота кишечника может быть недостающим звеном для понимания взаимозависимости между питанием, передачей сигналов 5-НТ и ее влиянием на метаболические заболевания, такие как ожирение.
11.Используя подходы in vitro и in vivo, мы продемонстрировали, что C. ramosum модулирует доступность 5-HT хозяина и что, в свою очередь, 5-HT запускает развитие кишечных предшественников в сторону энтероэндокринных клеток посредством изменений в экспрессии ключевых факторов транскрипции Hes1 и Atoh1. В наших экспериментах моноассоциация с C. ramosum усиливала ожирение, вызванное HFD, о чем можно судить по увеличению массы тела и eWAT, уровня 5-НТ в плазме и кишечной экспрессии транспортеров липидов после диеты с высоким содержанием жиров, все это согласуется с предыдущими исследованиями. результаты4 Анализ экспрессии генов в ткани толстого кишечника показал повышенные уровни мРНК ChA у мышей Cra независимо от диеты. Иммуноокрашивание и анализ содержания белка показали, что влияние C. ramosum на количество EC еще более выражено у мышей Cra, получавших HFD, по сравнению с мышами GF, получавшими HFD. Независимо от диеты транскрипционные факторы Nkx2.2 и Lmx1a значительно повышались в толстой кишке мышей Cra по сравнению с контрольными животными GF. NKX2.2 представляет собой гомеодомен-содержащий транскрипционный фактор, необходимый для развития островковых клеток поджелудочной железы. У мышей с кишечной делецией NKX2.2 у эмбриона или у взрослых наблюдается уменьшенное количество энтероэндокринных клеток, продуцирующих 5-HT, холецистокинин (CCK), GIP и гастрин43,44. LMX1A является транскрипционным фактором, который действует ниже NKX2.2, и его кишечная делеция приводит к снижению TPH1, ключевого фермента синтеза 5-HT44,45, что согласуется с нашими данными. Учитывая, что маркер стволовых клеток Lgr5 активируется в толстой кишке и большинство ChA-положительных клеток также являются ЭК, продуцирующими 5-НТ, мы предполагаем, что C. ramosum стимулирует пролиферацию и развитие стволовых клеток преимущественно в сторону ЭК, продуцирующих 5-НТ. но, возможно, также и к другим типам секреторных клеток. NEUROD, экспрессируемый в эндокринных клетках поджелудочной железы, кишечнике и мозге, необходим для образования секретина и клеток CCK45. Мы наблюдали уменьшение в подвздошной кишке и увеличение экспрессии гена NeuroD в толстой кишке у мышей Cra по сравнению с мышами, лишенными этого организма. - 1.Также показано, что микробные метаболиты напрямую влияют на выработку 5-НТ хозяином. Показано, что в толстой кишке стерильных мышей уровни экспрессии TpH1 снижаются , в то время как уровни экспрессии ферментов, регулирующих хранение, высвобождение и деградацию 5-НТ, остаются неизменными. Кроме того, многие исследования показали, что микробиота кишечника, особенно спорообразующие микробы, может способствовать выработке 5-HT из клеток EC посредством стимуляции TpH1 [37]. Наиболее хорошо изученными метаболитами, влияющими на синтез 5-НТ, являются короткоцепочечные жирные кислоты (КЦЖК) и вторичные желчные кислоты, особенно такие как ацетат, пропионат и бутират, возникают в результате анаэробной ферментации пищевых волокон в кишечнике и продуцируются бактериями, принадлежащими к Firmicutes и Bacteroidetes, двум наиболее доминирующим типам микробиома кишечника человека [60]. Микробные и пищевые КЦЖК стимулируют рецепторы свободных жирных кислот в клетках EC, что увеличивает выработку TpH1 и, следовательно, 5-HT.
2. Недавние эксперименты показали, что другие микробные метаболиты, такие как α-токоферол, холат, тирамин и п-аминобензоат, также увеличивают секрецию 5-HT из клеток EC, в то время как другие исследования показали, что тот же эффект вызывают бактериальные токсины, такие как холерный токсин и холерный токсин. Липополисахарид (ЛПС) Escherichia coli [37,62]. Триптамин, продуцируемый микробами , также может индуцировать выработку 5-HT в миентеральных нейронах.
3.Метаболизм 5-НТ хозяина влияет на состав и функционирование микробиоты Исследования in vitro показывают, что 5-НТ оказывает влияние на рост бактерий, поскольку в культурах E. coli и Rhodospirillum rubrum наблюдалось усиление роста и усиление агрегации клеток при введении 2 × 10-5 М 5-НТ. Однако противоположные результаты наблюдались при стимуляции более высокими концентрациями [66]. В свою очередь, доступность 5-НТ может влиять на состав микробиоты кишечника, поскольку было показано, что мыши TpH1+/- и TpH1-/- , демонстрирующие разное количество кишечного 5-НТ, имеют различия в составе микробиоты кишечника. Также было показано, что 5-HT напрямую ингибирует рост полезных бактерий на видовом уровне, а также выработку КЦЖК посредством ингибирования роста облигатных анаэробов в зависимости от концентрации [62].
4.Более того, 5-НТ может снижать экспрессию рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR)-γ , и тем самым выработку антимикробного пептида β-дефензина [68]. Интересно, что Bacteroides thetaiotaomicron и Enterococcus faecalis активируют PPAR-γ эпителия кишечника [69,70]. В других экспериментах было показано, что 5-HT ингибирует активацию PPAR-γ , подавляя рост этих микробов [62]. Другое исследование показало, что повышение доступности 5-НТ у мышей при пероральном введении или при удалении SERT увеличивает количество спорообразующих бактерий [71].
5.В случаях чрезмерной доступности 5-HT, как при воспалительных процессах [73–76], T. sanguinis колонизация увеличивается, а липидный обмен хозяина изменяется [71]. Предполагается, что бактерии, продуцирующие SCFA, такие как T. sanguinis, одновременно эволюционировали, чтобы стимулировать 5-НТ. синтез, который они впоследствии используют для успешной колонизации кишечника.
6.Моноамины, в том числе 5-НТ, вырабатываемые в ЭНС желудочно-кишечного тракта, могут влиять на иммунные ответы посредством активации HTR, обнаруженных на иммунных клетках [6,78].
7.Роль 5-HT в воспалении Во время воспаления кишечника количество ЭК-клеток часто увеличивается, что может привести к повышению уровня высвобождения 5-НТ [29]. В нормальных условиях большая часть 5-HT транспортируется через SERT в энтероциты для деградации или в тромбоциты для хранения [21,23,31], но при воспалении кишечника избыток 5-HT активирует местные иммунные клетки через HTR. Иммунные клетки, такие как Т-клетки, дендритные клетки (ДК) и макрофаги, способны запускать активацию провоспалительных путей и секрецию провоспалительных цитокинов. Кроме того, высвобождаемый 5-НТ действует как хемоаттрактант, привлекая лейкоциты к очагу воспаления [11]. Кроме того, при стимуляции микробами, растворимыми факторами, такими как факторы активации тромбоцитов или IgE-содержащие структуры, тромбоциты секретируют 5-НТ, который впоследствии активирует другие тромбоциты через HTR2A и HTR3, что приводит к внутриклеточному высвобождению Ca2+ и стабилизации активации тромбоцитов [11, 93].
8.Изменения метаболизма 5-НТ хорошо описаны у пациентов с ВЗК. У пациентов с БК наблюдается повышенная экспрессия TpH1, 5-HTR3, 5-HTR4 и 5-HTR7 и пониженная экспрессия SERT в тканях толстой кишки [111–
113].
9.Помимо прямого воздействия на иммунные клетки, 5-НТ также может влиять на перистальтику кишечника и воспаление кишечника, действуя на систему нейронов в кишечнике в качестве нейромедиатора. Нейрональный 5-НТ может индуцировать перистальтику кишечника и участвовать в кишечном нейрогенезе и дифференцировке , которая модулируется микробиотой [19,42,129]. Предполагается, что высвобождение 5-HT стимулирует HTR3, расположенный на сенсорных волокнах блуждающего нерва, что приводит к высвобождению ацетилхолина, что впоследствии приводит к сокращению мышц [49]. Кроме того, активация HTR3 и инозитол-1,4,5-трифосфатного пути может вызывать высвобождение Ca2+, что индуцирует сокращение миоцитов толстой кишки [49]. Нарушение регуляции метаболизма 5-НТ в кишечнике было описано у пациентов как с диареей, так и с синдромом раздраженного кишечника (СРК) с преобладанием запоров [130–132].
10.Пациенты с БК, находящиеся в стадии ремиссии и испытывающие симптомы, подобные СРК, также демонстрируют повышенный уровень TpH1 слизистой оболочки толстой кишки, что указывает на то, что нейрональный 5-НТ может быть катализатором возникновения симптомов [133]. Действительно, TpH1, по-видимому, играет роль в перистальтике кишечника, поскольку было показано, что мыши TpH1-/- не проявляют перистальтических рефлексов и имеют измененные фекальные гранулы [134].
11.Таким образом, помимо влияния на перистальтику кишечника, нейрональный синтез 5-НТ под действием TpH2, по-видимому, играет противовоспалительную роль во время воспаления кишечника [136]. Тем не менее, неясно, было ли ухудшение заболевания вызвано изменением перистальтики кишечника или отсутствием нейропротекторного эффекта 5-НТ [136]. Показано, что при ВЗК число кишечных нейронов увеличивается, что может быть связано с 5- НТ-опосредованной нейропротекцией и нейрогенезом за счет активации нейрональных рецепторов HTR4
12.СИОЗС СИОЗС представляют собой тип антидепрессантов, которые блокируют транспортер SERT и повышают доступность 5-НТ в синаптическом пространстве [144]. Хотя СИОЗС обычно назначают для лечения депрессии и тревоги, они также проявляют противовоспалительные свойства и влияют на состав микробиоты кишечника [145]. Например, флуоксетин обеспечивает более высокую экспрессию факторов споруляции и мембранных переносчиков у Turicibacter sanguinis за счет ингибирования подавляющей функции этих процессов с помощью 5-НТ, тем самым уменьшая колонизацию в кишечнике [71]
13.Хотя экспрессия SERT снижается при воспалительном заболевании кишечника [111] и наблюдалось, что грызуны SERT-/- страдают от более тяжелого химически индуцированного колита, введение СИОЗС на животных моделях, по-видимому, играет защитную роль при воспалении кишечника. Более конкретно, на животных моделях ВЗК было доказано, что два соединения, флуоксетин и флувоксамин, обладают противовоспалительным действием. Предварительное лечение мышей флуоксетином перед индукцией колита с помощью DSS снижает тяжесть заболевания, о чем свидетельствует длина толстой кишки и уменьшение гистологического повреждения, сопровождающееся подавлением пути NF-κB в эпителиальных клетках кишечника и снижением рекрутирования нейтрофилов [146]. . Флуоксетин также не влиял на высвобождение 5-НТ из ЭК-клеток. Однако следует отметить, что в этом исследовании вводились более высокие концентрации препарата, чем обычная дозировка, назначаемая пациентам. В другом исследовании флуоксетин также улучшал заболевание мышей IL-10-/- и снижал секрецию TNF-α и IL-12p40 [147]. Флувоксамин облегчал воспаление кишечника у мышей с колитом, вызванным уксусной кислотой, путем ингибирования пути NF-κB в эпителиальных клетках кишечника [148].
14.Трудно оценить эффективность СИОЗС у пациентов с ВЗК из-за отсутствия рандомизированных исследований [145]. Интересно, что два исследования «случай-контроль» показали, что прием СИОЗС может увеличить риск микроскопического колита [149,150]
15.Микробиота кишечника конкурирует с хозяином за доступный триптофан, а продукты метаболизма триптофана как хозяина, так и микробов активируют иммунные реакции, которые способствуют гомеостазу кишечника. Микробы способствуют синтезу 5-HT либо путем прямой продукции 5-HT, как было показано, по крайней мере, in vitro, либо путем секреции метаболитов, таких как SCFAs и вторичные желчные кислоты, которые могут стимулировать клетки EC к выработке 5-HT [40]. . Это говорит о том, что кишечные микробы могут снижать доступность триптофана в организме хозяина, но повышать доступность 5-НТ. Полученный от хозяина 5-HT может влиять на состав микробиоты кишечника, способствуя колонизации определенных видов против других, а 5-HT может ухудшать воспаление кишечника за счет подавления полезных микробов, которые улучшают гомеостаз кишечника как прямо, так и косвенно за счет ингибирования антимикробных пептидов. Однако другие исследования показывают, что 5-НТ, полученный от хозяина, индуцирует колонизацию микробными продуцентами КЦЖК, что в целом связано со здоровьем. Таким образом, хотя 5-НТ хозяина, вероятно, влияет на микробный состав в желудочно-кишечном тракте, необходимо провести дополнительные исследования, чтобы оценить, являются ли эти эффекты полезными или вредными
16. Более того, есть признаки того, что СИОЗС могут влиять на микробиоту кишечника, поскольку при лечении СИОЗС на животных моделях депрессии наблюдались изменения в их численности [71,151,152]. В будущем необходимо провести дополнительные исследования , чтобы выяснить, в какой степени эти последствия могут быть опасными или полезными для хозяина. - https://www.cmghjournal.org/action/showPdf?pii=S2352-345X%2819%2930005-0
- 17.В исследовании изучалось влияние серотонина (5-HT) на состав кишечной микрофлоры и развитие воспалительных заболеваний кишечника у мышей. Основные моменты исследования включали: Исследование влияния серотонина на кишечную микрофлору: Исследователи сосредоточились на мышах с дефицитом фермента Tph1, который необходим для синтеза серотонина в кишечнике, сравнивая их с нормальными мышами. Они обнаружили, что у мышей с дефицитом Tph1 был изменен состав кишечной микрофлоры и уменьшена восприимчивость к колиту, что указывает на важную роль серотонина в регуляции состава кишечной микрофлоры и воспалительных процессов в кишечнике. Изучение механизмов воздействия серотонина: Исследование показало, что серотонин может напрямую влиять на рост определенных видов бактерий в кишечнике и на производство антимикробных пептидов, таких как бета-дефенсины, что может влиять на устойчивость кишечника к воспалениям. Пересадка микробиоты: Одним из ключевых экспериментов была пересадка микробиоты из кишечника мышей с дефицитом Tph1 в кишечник нормальных мышей и наоборот. Этот эксперимент показал, что пересаженная микробиота может изменять восприимчивость к воспалению кишечника в реципиентах, подтверждая роль серотонина в модуляции взаимодействий между кишечными микроорганизмами и хозяином. Анализ влияния серотонина на генетические маркеры: Исследователи также изучали влияние серотонина на экспрессию различных генов, связанных с воспалением и защитой кишечника, включая гены антимикробных пептидов и маркеров воспаления.
- 1.Организм не рос аэробно, поэтому проводили анаэробную субкультуру. Анаэробный рост на кровяном агаре бруцелл с добавлением гемина и витамина К (ВА) давал чистую культуру в виде небольших, сероватых, гладких, круглых, негемолитических колоний с цельными краями через 48 часов, которые через 48 часов становились коричневыми при более длительной инкубации
2.Учитывая, что C. ramosum может окрашиваться как грамотрицательная палочка, мы решили повторно исследовать бутылку 1 с подозрением на полимикробную бактериемию. Таким образом, чтобы выяснить, присутствует ли C. ramosum , мы субкультивировали его в анаэробных условиях на БА, бруцеллу с добавлением витамина К, гемина и амикацина (БАА) и БАК с ванкомицином (БААВ). C. ramosum рос на БА и БАК через 48 ч инкубации; BA также дал E. coli . Попытки вырастить организмы на BAAV не увенчались успехом.
3.C. ramosum является одним из видов Clostridium . Сообщалось, что они окрашивают грамотрицательные клетки, несмотря на наличие типичной грамположительной клеточной стенки
4.Выделение и идентификация C. ramosum в полимикробной форме сопряжены с некоторыми трудностями. C. ramosum можно легко ошибочно идентифицировать или не заметить, поскольку он обычно окрашивается как грамотрицательная палочка, а его конечные споры трудно обнаружить [ 3, 17–19 ].
5.Окраска по Граму, возможно, является старейшим и наиболее укоренившимся методом, который до сих пор используется в микробиологических лабораториях. Хорошо известно, что некоторые грамположительные виды часто окрашивают грамотрицательные или граммвариабельные культуры по мере старения культур из-за изменений клеточной стенки с потерей жизнеспособности [ 20 ]. Хотя большинство видов Clostridium являются анаэробными, образующими эндоспоры и грамположительными палочками, некоторые виды могут быть окрашены грамвариабельно или грамотрицательно, и их споры может быть трудно обнаружить.
6.Некоторые из этих микроорганизмов принадлежат к так называемой «группе RIC»: C. ramosum, Clostridium innocuum и Clostridium clostridioforme [ 3 ]. C. ramosum может быть трудно распознать в лаборатории из-за вариабельности окраски по Граму и отсутствия спор, а также атипичной клостридиальной морфологии его колоний [ 3, 17–19, 21 ]. Сообщалось, что потеря грамположительного вида чаще всего происходит при прямом окрашивании клинического материала или в культурах после инкубации в течение длительного периода времени, или у видов, демонстрирующих терминальные споры [ 3, 22 ]. Следовательно, C. ramosum может быть ошибочно отнесен к другим родам, поэтому количество положительных культур, вероятно, занижено [ 23 ].
7.В нашем случае микроорганизм представлен в виде тонких грамотрицательных палочек, что затрудняет микробиологическую интерпретацию. Фактически, анаэробная субкультура изначально не проводилась для бутылки 1, поскольку это было интерпретировано как демонстрирующее мономикробный рост, т.е. E. coli . Врачи и микробиологи должны поддерживать высокий уровень осведомленности, поскольку окраска по Граму культуры крови может быть неправильно истолкована [ 17, 24 ].
8.В настоящее время используются несколько коммерчески доступных методов идентификации, начиная от систем на основе ферментов и заканчивая новыми методами молекулярной ПЦР (такими как секвенирование 16S рРНК) и MALDI-TOF MS. Однако большинство наборов для биохимической идентификации C. ramosum необходимо дополнять дополнительными тестами для полной идентификации организма [ 3, 18, 25, 26 ]. Кроме того, карты ANC (VITEK 2, bioMérieux, Франция) идентифицировали C. ramosum как C. clostridioforme [ 27 ]. По всем этим причинам ген 16S рРНК необходимо секвенировать для подтверждения идентификации [ 1, 9 ]. Эти факторы, вероятно, приводят к занижению данных об этом виде клостридий при инфекциях человека [ 28 ].
9.В целях диагностики и лечения важно обеспечить быструю и точную идентификацию видов Clostridium . Современная тенденция заключается в том, что инструментальные методы заменяют традиционные микроскопические и биохимические исследования для быстрой идентификации. Однако секвенирование гена 16S рРНК требует много времени, что может помешать этому, возможно, стать рутинным подходом. Современные альтернативы, такие как MALDI-TOF MS, предлагают быстрое, точное, чувствительное, надежное и недорогое решение для рутинной характеристики и типирования микробов в лабораториях. Фактически, как VITEK MS (база данных VITEK MS 2.0, bioMérieux, Франция), так и MALDI-TOF MS
10.ХРБ особенно встречается у взрослых, предрасположенных к инфекции из-за злокачественных новообразований и иммуносупрессии, а также у пациентов с перфорацией кишечника и образованием абсцесса [ 6, 31, 32 ], а также у иммунокомпетентных пациентов [ 28 ]. В опубликованных ретроспективных сериях случаев CRB составлял 0–13% случаев CB [ 4, 33 ]. В медицинской литературе мало случаев, задокументированных CRB
11.Сообщалось, что C. ramosum вызывает остеомиелит, септический артрит, мастоидит, спондилодисцит, средний отит, пиелонефрит, септические артериальные эмболии, эндокардит, газовую гангрену, септический псевдоартроз, перитонит, связанный с перитонеальным диализом, абсцесс печени, абсцесс головного мозга, абсцесс мозжечка, поражение легких. абсцесс, гангрена Фурнье, псевдомембранозный колит, инфицированная аневризма грудной аорты и инфекция внутричерепной эхинококковой кисты.
12.Абсцесс в случае абсцесса мозжечка, вторичного по отношению к среднему отиту, у 5-летнего мальчика с двусторонним хроническим гнойным средним отитом в течение 4 лет, в течение которого он лечился без эффекта [ 21 ].
13.CB часто имеет полимикробную картину [ 50 ]. Множественная бактериемия является признаком внутрибрюшинного сепсиса [ 51 ]. C. ramosum обитает в кишечном тракте и лишь в редких случаях вызывает тяжелые инфекции [ 52–54 ]. Как и в других сериях, у нашего пациента мы подозреваем абдоминальный источник из-за клинической и полимикробной картины с участием кишечной бактерии, т.е. E coli [ 55 ]. Хотя C. ramosum непатогенен, он способен продуцировать протеазы иммуноглобулина А1 и А2, которые могут способствовать проникновению в слизистую оболочку кишечника, позволяя бактериям избежать защиты слизистой оболочки у особенно восприимчивых пациентов
14.С другой стороны, интересно отметить растущее значение C. ramosum при других заболеваниях, помимо инфекционных состояний. Микробиом кишечника в настоящее время является областью интенсивных исследований. В недавних исследованиях C. ramosum была связана с ожирением, диабетом, злокачественными новообразованиями, энтерогеморрагической инфекцией E. coli (EHEC), а также внимание было обращено на ее использование в качестве иммунизационного лечения или в качестве биомаркера рака [ 58–66 ].
15.Пожилой возраст увеличивает риск клостридиальной инфекции независимо от сопутствующих заболеваний, что можно объяснить возрастным увеличением количества клостридиальных видов в нормальной микробиоте кишечника [ 41 ]. Более того, как и в нашем случае, ХРБ может быть связан с высокой смертностью [ 6 ]. В одном исследовании CB C. ramosum вошел в тройку изолятов с наиболее высокими показателями смертности [ 41 ]. Примечательно, что 9 из 22 (41 %) зарегистрированных случаев ХРБ имели летальный исход (из них у 6/9 (66 %) была полимикробная бактериемия), а 9 из 22 (41 %) были полимикробными. Из 31 случая инфекции C. ramosum , по имеющимся данным, в 26 (84 %) наблюдалась лихорадка. Только у 1/11 пациентов, у которых не было выявлено ХРБ, был летальный исход
16.С другой стороны, важно учитывать, что короткое ТТП, как сообщается, является независимым предиктором фатального исхода у пациентов с бактериемией E. coli из разных источников [ 73 ]. Предыдущие исследования показали, что TTP короче у пациентов с бактериемией E. coli неизвестного происхождения или вне мочевыводящих путей, у женщин, в случаях шока или тяжелого сепсиса или у умерших пациентов. Действительно, бактериемия E. coli была независимым предиктором фатального исхода у пациентов с бактериемией различных источников
17.Все эти факты – отрицательный посев мочи, короткое ТТП (3 часа) для флакона 1 ( E. coli и C. ramosum ) и пожилой пациент с ослабленным иммунитетом и абдоминальными симптомами – привели нас к подозрению фатальной бактериемии E. coli .
18.C. ramosum был чувствителен к ампициллину, пиперациллину/тазобактаму, цефокситину, имипенему, клиндамицину и метронидазолу. Однако важно учитывать, что этот вид может продуцировать β-лактамазы и проявлять вариабельную чувствительность к другим антибиотикам, таким как пенициллин, цефокситин, хинолоны, клиндамицин и цефалоспорины [3, 18, 41, 76–78, 28, 28, 28, 28]. 44]. Сообщалось также об устойчивости к карбапенемам [28].
19.Для пожилых лежачих пациентов с ревматоидным артритом в анамнезе, длительным лечением стероидами и впервые возникшей лихорадкой ХРБ может привести к летальному исходу с разрушительными последствиями, несмотря на адекватное хирургическое и медицинское лечение.
20.Его частота, вероятно, недооценена, поскольку Clostridium spp. Наблюдаемые в виде грамотрицательных тонких палочек встречаются довольно редко и могут быть нераспознаны при полимикробной бактериемии. Интерпретация и тщательное наблюдение за окраской по Граму и правильная обработка культур крови были очень важны для бактериологической диагностики ХРБ. MALDI-TOF MS представлял собой быстрый и надежный метод идентификации C. ramosum . Систематический обзор. - 21.принадлежит к комменсальной микробиоте кишечника человека, хотя некоторые штаммы обладают способностью продуцировать протеазы IgA1 и IgA2, тем самым увеличивая восприимчивость хозяина к условно-патогенной бактериальной инвазии путем транслокации через слизистую оболочку кишечника
22.Из-за множества трудностей, связанных с правильным выращиванием E. ramosum в культуре и ее идентификацией с помощью рутинных микробиологических методов, частота как возможных эндогенных, так и экзогенных инфекций, вызванных E. ramosum , считается недооцененной в реальной клинической практике. Использование современных диагностических методов, таких как масс-спектрометрия, показало, что различные анаэробные грамположительные бактерии, которые не считаются столь распространенными, могут вызывать абсцессы головного мозга 6 . Инвазивные инфекции, такие как бактериемия 5 , септический артрит 7 , септический псевдоартроз 8 , остеомиелит 9 , абсцесс мозжечка 10 , абсцесс легкого 11 , гангрена Фурнье 12 , газовая гангрена 13 , спондилодисцит 14 , псевдомембранозный колит 15 , септическая артериальная эмболия 16 среди прочего, может быть связано с высоким риском смерти.
23.E. ramosum демонстрирует превосходную чувствительность к пиперациллин-тазобактаму, амоксициллину/клавуланату, ампициллину/сульбактаму, имипенему, меропенему, метронидазолу, ванкомицину и хлорамфениколу. Чувствительность к пенициллину и цефалоспоринам варьируется, скорее всего, из-за продукции β-лактамаз некоторыми штаммами E. ramosum 5 , 14 . Аналогичным образом сообщалось о противоречивых результатах, связанных с чувствительностью к клиндамицину. Вероятно, существует внутренняя устойчивость к аминогликозидам, фторхинолонам, рифампицину и большинству тетрациклинов
24.у пациентов любого возраста и пола с синдромом системной воспалительной реакции (ССВО), вызванным E. ramosum , выделенным из жидкостей организма или тканей, в которых он обычно не присутствует. и идентифицированы одним или несколькими из следующих диагностических методов: традиционные методы, такие как морфология колоний, стандартизированные биохимические реакции, газожидкостная хроматография, коммерческие наборы анаэробов и др., а также более сложные и точные методы, такие как матричный лазер десорбционно-ионизационная времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) и видоспецифическая полимеразная цепная реакция (ПЦР) для E. ramosum
25.Средний возраст субъектов с зарегистрированной инвазивной инфекцией, вызванной E. ramosum , составлял 66 лет (IQR 26, 74), причем самому старшему из них был 91 год, а двум самым младшим - 3 года и 6 месяцев соответственно. Чуть больше половины заболевших составили мужчины (11/19 или 57,9%)
26.Среди сопутствующих заболеваний/иммунокомпрометированных состояний наиболее часто сообщалось о различных типах рака (4/19 или 21%), за ними следовали хроническая почечная недостаточность, леченная на диализе (2/19 или 10,5%), сахарный диабет (2/19 или 10,5%) и инфицированные глубокие пролежни (2/19 или 10,5%); о других патологических состояниях сообщалось спорадически (Таблица 1). У двух детей (10,5% от общего числа случаев) со средним отитом выявлена предрасположенность к инвазивной инфекции, вызванной E. ramosum , из них у старшего ребенка (5 лет) - хроническая гнойная форма - абсцесс мозжечка, представляющий собой внутричерепное осложнение (Таблица 1). E. ramosum как возбудитель послеоперационных инфекций отмечен у трех пациентов (15,8%)
27.Культура крови была наиболее часто используемым тестом для выявления E. ramosum (10/19 или 52,6%) (Таблица 1). E. ramosum как причина инфекции чаще всего первоначально выявлялась исключительно биохимическими методами (7/19 или 36,8%), тогда как дополнительное подтверждение с помощью секвенирования гена 16S рРНК проводилось в трех случаях (15,8%). Комбинация этих двух методов с масс-спектрометрией MALDI-TOF (т.е. тройной метод диагностики) использовалась в трех (15,8%) случаях. Секвенирование 16S рРНК как единственный метод идентификации E. ramosum было выполнено у двух пациентов (10,5%), а также использование только газожидкостной хроматографии (2/19 или 10,5%). Наконец, в двух случаях (10,5%) не был указан метод идентификации бактерий.
28.У тринадцати пациентов (68,4%) были признаки и симптомы системной инфекции, причем наиболее частым симптомом была лихорадка (12/19 или 63,2%). У шести пациентов (31,6%), включенных в наше исследование, не было зарегистрировано ни одного из потенциальных показателей системного воспалительного ответа на инфекцию, таких как лихорадка, тахикардия, учащенное дыхание и гипотония.
29.Максимальный уровень прокальцитонина не был зарегистрирован ни у одного из пациентов, включенных в наше исследование. Дополнительные морфологические, рентгенологические и/или эндоскопические диагностические процедуры были выполнены более чем в половине случаев (11/19 или 57,9%), при этом были подтверждены следующие диагнозы: септический артрит и остеомиелит - в двух случаях (10,5%), при этом псевдомембранозный колит, спондилодисцит, пиомиома, эндокардит, абсцесс мозжечка, инфицирование внутричерепной эхинококковой кисты и инфицирование аневризмы грудного отдела аорты - по одному случаю (5,3%). Измененные лабораторные данные, указывающие на специфическую инфекцию органа/ткани, были зарегистрированы в двух случаях: у пациента на перитонеальном диализе с перитонитом с более чем 7000/мм 3 лейкоцитов (с преобладанием нейтрофилов), измеренных в диализате, и у пациента с септическим артритом. , 95 000/мм 3 лейкоцитов (94% нейтрофилов), измеренных в суставной жидкости. В целом E. ramosum чаще всего оказывался возбудителем инфекций кровотока (6/19 или 31,6%)
30.Тестирование чувствительности E. ramosum к противомикробным препаратам было проведено у восьми пациентов (42,1%), а суммарная картина чувствительности этих изолятов представлена на рисунке.Рисунок 3. Почти две трети всех изолятов (5/8 или 62,5%), то есть изолятов, собранных от пяти из общего числа 19 включенных случаев, были протестированы на чувствительность к метронидазолу и пенициллину, а чувствительность E. ramosum к метронидазолу была подтверждена в все пять случаев (чувствительность 100%), при этом у одного пациента эта бактерия оказалась устойчивой к пенициллину (чувствительность 80%). В исследованиях, в которых сообщалось, что более двух изолятов проверялись на чувствительность к конкретным антибиотикам, все они были чувствительны к амоксициллину/клавуланату (4/12 или 33,3%) и пиперациллину/тазобактаму (3/12 или 25%). . Наконец, помимо пенициллина, были также зарегистрированы отдельные случаи устойчивости E. ramosum к клиндамицину, ципрофлоксацину, имипенему и эртапенему.
31.Лечение инвазивных инфекций, вызванных E. ramosum, у большинства пациентов (12 из 19, или 63,2%) включало применение более одного противомикробного препарата, тогда как моноантибиотическая терапия применялась в семи случаях (36,8%). Метронидазол был наиболее часто используемым антибиотиком (7/19 или 36,8%), за ним следовали меропенем (5/19 или 26,3%) и амоксициллин (4/19 или 21%) (Рисунок 4). У большинства пациентов (12 из 19 или 63,2%) соответствующее клиническое улучшение было зарегистрировано после терапии антибиотиками, тогда как у четырех пациентов (21%) наблюдалось полное выздоровление. Сообщалось о летальном исходе у одного пациента с бактериемией и у одного пациента с остеомиелитом, которому была произведена ампутация из-за неэффективности антибиотикотерапии. Наконец, эффективность антибиотикотерапии не была полностью ясна у одного пациента с перитонитом. Побочные эффекты применяемых антибиотиков были зарегистрированы только для клиндамицина, который был отменен у пациента с псевдоартритом после восьми месяцев непрерывной терапии из-за возникновения серьезных побочных эффектов со стороны желудочно-кишечного тракта. Лечение антибиотиками, применяемое у отдельных пациентов, показано на рис.
32.Этот систематический обзор подтвердил клиническую значимость E. ramosum как причины различных тяжелых инфекций, главным образом у стационарных пациентов с ослабленным иммунитетом. Эти оппортунистические инфекции, из которых чаще всего сообщалось об инфекциях кровотока, поражали как детей, так и взрослых, причем преимущественно у пожилых пациентов. Наиболее распространенными хроническими заболеваниями, связанными с иммунодефицитом, были различные виды рака, сахарный диабет и терминальная стадия почечной недостаточности, леченные с помощью гемодиализа и/или перитонеального диализа, аналогично возникновению инфекций, вызванных другими анаэробными патогенами
33.В одной шестой всех случаев для подтверждения идентификации выделенного E. ramosum использовались новые сложные молекулярные методы, такие как масс-спектрометрия MALDI-TOF и секвенирование гена 16S рРНК
34.Серьезные инфекции, вызванные E. ramosum, в большинстве случаев эффективно лечились антибиотиками, за исключением двух пациентов, один из которых умер.
35.Более одного изолята E. ramosum продемонстрировали 100% чувствительность к метронидазолу, амоксициллину/клавуланату и пиперациллину/тазобактаму, в отличие от отдельных штаммов этой бактерии, устойчивых к пенициллину, ципрофлоксацину, клиндамицину, имипенему и эртапенему, о которых также сообщалось.
36.Интересно, что, как и наиболее известный и наиболее важный оппортунистический патоген человека из класса Clostridia , т.е. Clostridium difficile 23 , E. ramosum также оказался возбудителем псевдомембранозного колита и бактериемии у пациентов пожилого возраста после предыдущего применения антибиотики широкого спектра действия (фторхинолоны и бета-лактамы) 15 . Кроме того, E. ramosum вызвал острую инфекцию среднего уха 4 , приводящую к внутричерепному абсцессу как осложнение гнойного хронического среднего отита 10 у маленького ребенка. Как упоминалось ранее, эти две целевые группы пациентов уже давно признаны восприимчивыми к инфекциям E. ramosum
37.Высокий риск заражения E. ramosum , вероятно, связан с недоразвитием и дисфункцией барьера слизистой оболочки кишечника у маленьких детей и взрослых/пожилых пациентов с иммунодефицитом, что позволяет уникальным факторам вирулентности (IgA-протеазам) этой комменсальной анаэробной бактерии способствовать проникновению хозяина и вызывать инфекцию в различных местах, обходя защиту хозяина 5 . Однако в редких сообщениях E. ramosum описывалась как возбудитель инвазивных инфекций у явно иммунокомпетентных лиц с осложненными доброкачественными заболеваниями или с постоянными медицинскими устройствами из-за сепсиса после перфорации кишечника, неизвестного доброкачественного желудочно-кишечного заболевания у детей дошкольного возраста 4 , послеродовой пиомиомы.24 , спондилодисцит у пожилого пациента с доброкачественной гиперплазией предстательной железы 14 , вторичная инфекция гидатидной кисты, расположенной в головном мозге 7-летнего ребенка, ранее подвергавшегося инвазивной диагностике и лечебным процедурам по поводу эмпиемы плевры 25 , эндокардит у пожилого пациента с предшествующей заменой аортального клапана биопротезом 26 и остеомиелитом после травматического повреждения (открытый перелом длинных костей) 9 . Последнее обращает внимание на потенциальное повсеместное распространение спор E. ramosum , которые, как и другие виды Clostridium , вероятно, возникли из почвы и попали в организм через открытую травматическую рану 9 .
38.E. ramosum вместе с Clostridium innoculum и Clostridium clostridioforme относится к уникальной RIC-группе клостридий (аббревиатура образована от начальных букв названий бактерий; R- ramosum , I- innoculum , C- lostridioforme ), которые являются часто ошибочно идентифицируются или не наблюдаются в клинических изолятах рутинными микробиологическими методами из-за трудностей в отличии их от других анаэробных бактерий. Причиной этого является непостоянный характер окрашивания по Граму (обычно сначала отрицательный), типичное образование терминальных спор, которые могут отсутствовать или их трудно идентифицировать, а также атипичная морфология колоний 6 , 22 , 27 . Эти факторы, вероятно, объясняют мнение о том, что инфекции, вызванные E. ramosum , основанные на его правильной идентификации как единственного возбудителя, присутствующего в положительных культурах, недооцениваются в повседневной клинической практике.
39.Масс-спектрометрия MALDI-TOF также использовалась в некоторых случаях 8 , 21 как революционный, более привлекательный и точный метод идентификации бактерий на основе их белкового профиля, но окончательное подтверждение наличия E. ramosum , по-видимому, требует дальнейшего использования анализа бактериального генома 8 . Поскольку рутинной лабораторной идентификации этой бактерии не существует, по возможности следует использовать современные современные методы, такие как секвенирование гена 16S рРНК, либо в сочетании, либо в качестве единственного диагностического метода для подтверждения изолятов E. ramosum . особенно при культурально-отрицательных инфекциях
40.Как упоминалось ранее, хотя антибиотики, обладающие бактерицидной активностью в отношении E. ramosum , в целом эффективны как в монотерапии, так и в комбинированном режиме, рекомендуемое лечение инфекций, вызванных этим конкретным видом клостридий, еще не определено.
41.Предыдущие исследования показали, что штаммы E. ramosum , продуцирующие бета-лактамазы, проявляют устойчивость к пенициллину в 20% случаев 27-29 , поэтому этот антибиотик не может быть рекомендован для лечения инфекций, вызванных E. ramosum , из-за потенциальной терапевтической неэффективности E. ramosum. Точно так же следует избегать использования клиндамицина или цефалоспоринов, поскольку E. ramosum часто демонстрирует вариабельную чувствительность к этим антибиотикам, как и другие виды клостридий
42.Как упоминалось ранее, устойчивость штаммов E. ramosum к антибиотикам не является широко распространенной. Эта анаэробная палочка показала высокий уровень устойчивости только к рифампицину, аминогликозидам, фторхинолонам и тетрациклинам
43.Неудача антибиотикотерапии, несмотря на использование нескольких антибиотиков с доказанной in vitro активностью в отношении E. ramosum , которая может привести к смерти или другим серьезным осложнениям, вероятно, будет связана с неконтролируемым прогрессированием тяжелого основного заболевания или с массивной бактериальной инвазией, связанной с чрезвычайно слабый иммунный ответ хозяина, как это наблюдалось у пациентов, охваченных этим обзором - Исходя из изученной информации можно попытаться изобразить и описать жизненный цикл Ramosum и его значение как патогена.
-
Свойства генотоксина и возможные последствия
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm3233